Asuna Kagurazaka — place n° 8 — (doublage en version française par Isabelle Volpe), la cancre irascible et personnage féminin principale, et ayant beaucoup de points communs avec Naru Narusegawa. Elle est aussi toujours en conflit avec les autres. Asuna a craqué pour son ancien professeur d'anglais, M. Takahata, que Negi remplace. Asuna est orpheline, et a été grauitement acceptée à l'école par le doyen ; maintenant Asuna essaie de payer elle-même son inscription en distribuant des journaux. Quoiqu'elle en dise, elle est membre des « Baka Rangers », le surnom pour les cinq plus mauvaises élèves de la classe. Elle est « Baka Red ». Elle a une hétérochromie et donc ses yeux sont bleu et vert (mais dans la deuxième série, Negima!?, elle a les yeux bleu). C'est beaucoup plus remarquable dans l'animé, car si dans l'animé les deux yeux sont bien différents, ils sont presque identiques dans la version manga. Asuna est la première à découvrir le secret de Negi quand elle le voit évitant à Nodoka de tomber dans les escaliers. Negi et Asuna ont une relation très fragile au début mais qui s'améliore après, avec Negi devenant comme un petit frère pour elle et Asuna comme une grande sœur/protectrice pour lui ; leur relation semble, très occasionnellement, commencer à éventuellement se développer vers une relation plus platonique. Asuna est la première personne avec qui Negi fit un contrat probatoire. Son artefact aurait dû être une épée géante, mais est devenu plutôt un éventail géant ; elle l'utilise néanmoins avec enthousiasme et efficacité. Cependant, l'épée apparut la première fois quand Asuna était inquiète et qu'elle essayait de sauver Negi des requins dans le chapitre 61, ce qui signifie que les émotions jouent un rôle dans son invocation de l'épée. Elle une immunité à la plupart des magies contre elle comme les philtres d'amour ou les sorts de pétrification. Asuna peut avoir rencontré dans son enfance Maître Thousand ce qui peut expliquer sa forte résistance à la magie. Il est évident qu'elle est attirée par les hommes mûrs, comme le montre son attirance pour Takahata ou sa réaction quand elle rencontre le père de Konoka.

Konoka Konoe — place n° 13 —, une fille gentille et attentionnée qui vit avec Asuna et Negi. Elle est la médiatrice dans la chambre de Asuna et Negi, étant à la fois la meilleure amie de Asuna et la première supportrice de Negi. Elle est aussi la petite-fille du doyen de l'école. Amatrice de bonne aventure, elle a beaucoup de potentiel magique, étant issue d'une famille de mages puissants. Son père est le chef de l'Association Magique du Kansai, qui a épousé sa mère, la fille du doyen de l'école, par un mariage arrangé pour apaiser les tension entre les associations magiques du Kansai et du Kantou (où l'Académie Mahora est située et le doyen vit). (Ceci parce que les mages du Kantô utilisent un magie de type occidental venue d'Europe, et cela fâcha les mages du Kansai qui utilisent une magie orientale d'Extrême-Orient, parce qu'ils voient les mages du Kantou oubliant les traditions et devenir plus occidentaux). Elle est la quatrième personne que Negi lia par un contrat probatoire et a la capacité magique de soigner les blessures. Elle a une forte affection pour Setsuna, et cela fait que leur relation semble prend un tour plus romantique (il semble parfois, vraiment, que leur relation en a le potentiel). Konoka ressemble à Tomoyo Daidouji de Cardcaptor Sakura.

Setsuna Sakurazaki — place n° 15 —, une experte du kendo entraînée au style du Kyōto Shinmei. Elle ressemble à Rinka Yoshino from Samurai Shodown Warrior's Rage. D'abord venue du Kyōto, c'est une amie d'enfance de Konoka et elle agit souvent comme sa protectrice. Parfois, sa dévotion pour Konoka et l'affection de Konoka envers elle font penser à une relation plus romantique (il semble parfois, vraiment, que leur relation en a le potentiel). Cependant, elle communique rarement avec Konoka, car elle pense qu'elle devrait être sa « protectrice dans l'ombre » pour ainsi dire. Mais la vérité est qu'elle a des ailes d'ange car elle est mi-humaine, mi-oiseau, craignant que Konoka ou quiconque la haïsse. Mais Negi, Asuna et Konoka, qui étaient les premiers à le découvrir, sont devenus ses amis même après avoir découvert qui elle est. Les seules personnes qui connaissent son secret sont Asuna, Konoka, Eva, Chachamaru et Negi qui ont tous accepté de garder le secret. Après l'incident de Kyōto, elle est devenus plus ouverte, même en étant avec Konoka. Elle va occasionnellement faire des exorcismes avec Mana Tatsumiya. Elle est la troisième personne avec laquelle Negi fit un contrat probatoire. Note intéressante : le style de kendo que Setsuna utilise est le même que celui utilisé par Motoko Aoyama de Love Hina. Cela a laissé penser les fans à un cross over possible entre les deux séries créées par le même auteur, Ken Akamatsu. Et elle a été la première fille à battre Makie Sasaki pour la première place dans les votes des lecteurs.

Ayaka Yukihiro — place n° 29 —, la riche et snob présidente de la classe. La plupart du temps, c'est la seule à vouloir conserver un semblant d'ordre dans la classe, en raison de l'inexpérience de Negi dans la gestion de groupes, et lutte en permanence avec Asuna. Les deux semblent se détester, mais il est évident qu'elle ont une drôle d'amitié qu'aucune n'acceptera. Ayaka est follement amoureuse de Negi, bien qu'elle veuille faire penser qu'elle n'est intéressée par Negi seulement parce que il a besoin d'une figure maternelle. Elle tend à être agressive dans à peu près tout ce qu'elle fait, ce qui lui vaut d'être mécomprise. Cependant, elle excelle dans la dissimulation de son propre passé (son jeune frère est mort à la naissance, ce qui explique sa fixation sur Negi). Elle est dans la même chambre que Chizuru Naba et Natsumi Murakami et fait partie du club d'équitation et de ikebana. Autre note : Ayaka fait partie des cinq filles de la classe qui ont les plus gros seins, et a la cinquième plus grosse poitrine.

Makie Sasaki — place n° 16 —, la délicate gymnaste artistique. Elle a une forte attraction pour Negi et est amie avec Yuuna Akashi, Ako Izumi et Akira Ookouchi qui sont aussi dans les clubs de sport. Elle est membre des Baka Rangers, le surnom pour le groupe des plus mauvaises élèves de la classe, pointant en tant que deuxième plus mauvaise (seule Asuna fait pire qu'elle). Elle est Pink Ranger. Dans quelques votes de lecteurs, elle a régulièrement été élue n° 1 et est la fille la plus populaire de la classe 3A.

Kû-Fei — place n° 12 —, l'énergique et joviale Chinoise, combattante de kung-fu. Elle ressemble beaucoup à Kaolla Sû de Love Hina (bien que moins gamine). Elle est membre des « Baka Rangers », parmi lesquelles elle est « Baka Yellow ». Elle dit qu'elle ne peut pas se concentrer plus sur ses études car elle « prend la plupart de son temps » pour étudier le japonais. Elle déteste être utilisée en cobaye pour les inventions de Chao et de Satomi. C'est aussi l'une des rares filles de la classe à connaître le secret de Negi quand Mana, Kaede et elle aidèrent Negi, Asuna et Setsuna à sauver Konoka à Kyōto.

Nodoka Miyazaki (宮崎 のどか) — place n° 27 —, la timide fan de livres. Membre du Groupe d'Exploration de la Bibliothèque, et aide à la librairie, elle passe tant de temps à la bibliothèque que les gens extérieurs au Groupe d'Exploration l'appellent "Bibliothèque", "Librairie", etc. Quand Negi est arrivé, elle avait toujours une mèche devant les yeux, alors que maintenant sa coupe de cheveux découvre généralement un œil (et un seul) ; plus tard elle porte une queue de cheval, ce qui découvre son visage. Après que Negi l'a attrapée lors de sa chute dans les escaliers, elle a conçu un amour pour Negi, qui semble réciproque et intéressant, car elle n'aime pas les garçons. Note intéreressante, elle ressemble beaucoup à Shinobu Maehara de Love Hina, du même auteur, Ken Akamatsu. Nodoka est la deuxième élève avec laquelle Negi fit un contrat probatoire. Son objet magique est un agenda qui montre les pensées de toute personne dont elle dit le nom, et a sauvé Negi et ses compagnons plus d'une fois.

Yue Ayase — place n° 4 —, la flemmarde tranquille. En dépit de son talent, elle déteste étudier et reste parmi celles qui ont les plus mauvaises notes de la classe. Elle est membre des « Baka Rangers », le surnom pour les cinq plus mauvaises élèves de la classe de Negi (elle est « Baka Black » et est considérée comme leur leader), et est membre du Groupe d'Exploration de la Bibliothèque, traînant souvent avec Haruna et Nodoka. Elle est une fervente supportrice de Nodoka, et l'encourage à développer une relation avec Negi. Elle est aussi une des rares filles de la classe à connaître le secret de Negi, qu'elle a découvert par elle-même en confrontant les preuves et les incidents étrangers depuis l'arrivée de Negi. En fait, c'est elle qui a appelé Kaede, Ku Fei et Mana à l'aide quand le quartier-général de l'Association Magique du Kansai a été attaqué par les gens qui ont kidnappé Konoka à Kyōto. Elle est toujours vue en train de boire du lait de tomate ou du thé au cola.

Haruna Saotome — place n° 14 —, la marchande de rumeurs de la classe et camarade habituel de Yue Ayase et de Nodoka Miyazaki. Si une rumeur circule dans la classe, elle en est probablement à l'origine. De plus, en tant que membre du Club d'Exploration de la Bibliothèque, elle semble avoir décidé de mettre Nodoka avec Negi - que Nodoka veuille son aide ou non.

Fûka Narutaki — place n° 22 —, l'aînée des jumelles Narutaki. C'est la farceuse de la classe, et semble toujours chercher un moyen d'avoir des problèmes. La plupart du temps, elle attend que Fumika l'aide à s'en sortir. Elle, sa sœur et Sakurako sont des enfants hyper-actifs.